Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ss18Q62280 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ss18Q62280 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ss18Q62280 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ss18Q62280 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ss18Q62280 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ss18Q62280 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ss18Q62280 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ss18Q62280 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ss18Q62280 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ss18Q62280 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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