Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprmP28828 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
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