Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prim1P20664 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Prim1P20664 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms