Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Phf11bB4XVQ1 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Phf11bB4XVQ1 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Phf11bB4XVQ1 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Phf11bB4XVQ1 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Phf11bB4XVQ1 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Phf11bB4XVQ1 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Phf11bB4XVQ1 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Phf11bB4XVQ1 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Phf11bB4XVQ1 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Phf11bB4XVQ1 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms