Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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Limd1Q9QXD8 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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Limd1Q9QXD8 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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Limd1Q9QXD8 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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Limd1Q9QXD8 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Limd1Q9QXD8 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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Limd1Q9QXD8 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Mtus1-205ENSMUST00000118835 6426 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Limd1Q9QXD8 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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