Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Rabgef1Q9JM13 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Rabgef1Q9JM13 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Rabgef1Q9JM13 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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Rabgef1Q9JM13 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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Rabgef1Q9JM13 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Rabgef1Q9JM13 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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