Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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