Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Usp38Q8BW70 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 Vmn1r72-202ENSMUST00000209638 6501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Usp38Q8BW70 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Usp38Q8BW70 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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