Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm16471-201ENSMUST00000121940 618 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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