Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm24989-201ENSMUST00000104461 88 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm3810-201ENSMUST00000122413 476 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.2 ms