Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm19807-201ENSMUST00000173971 667 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r51-205ENSMUST00000227109 4214 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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