Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr741-203ENSMUST00000213903 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Igkv15-101-1-201ENSMUST00000196661 258 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
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