Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm44409-201ENSMUST00000198810 166 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ptchd1Q14B62 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms