Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms