Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Rpl28P41105 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Rpl28P41105 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Rpl28P41105 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Rpl28P41105 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms