Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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PtprmP28828 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 AC113059.2-201ENSMUST00000213462 3016 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PtprmP28828 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprmP28828 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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PtprmP28828 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprmP28828 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprmP28828 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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PtprmP28828 Slco1a4-203ENSMUST00000165990 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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PtprmP28828 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PtprmP28828 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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PtprmP28828 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
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PtprmP28828 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprmP28828 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtprmP28828 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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