Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm5899-201ENSMUST00000071770 270 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Prim1P20664 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms