Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
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