Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Spocd1B1ASB6 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Spocd1B1ASB6 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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