Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr593-201ENSMUST00000098206 984 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC4.53□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Grik3B1AS29 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms