Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Rtf1A2AQ19 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
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Rtf1A2AQ19 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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Rtf1A2AQ19 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Rtf1A2AQ19 AC131068.3-201ENSMUST00000228438 1456 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms