Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm45615-201ENSMUST00000210417 656 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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