Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Scgb2b28-ps-201ENSMUST00000188974 337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm21718-202ENSMUST00000186974 817 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Six6Q9QZ28 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Six6Q9QZ28 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Six6Q9QZ28 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Six6Q9QZ28 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Six6Q9QZ28 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm43814-201ENSMUST00000197851 413 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Six6Q9QZ28 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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