Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Smpx-202ENSMUST00000112520 503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp29Q9ES63 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms