Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm5757-201ENSMUST00000117494 528 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm22988-201ENSMUST00000122759 144 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Gm6058-201ENSMUST00000154261 399 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Ccdc47Q9D024 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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