Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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