Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Gm22304-201ENSMUST00000082688 129 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trappc2Q9CQP2 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm12568-201ENSMUST00000117362 624 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Trappc2Q9CQP2 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms