Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
NischQ80TM9 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC7□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
NischQ80TM9 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms