Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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NipblQ6KCD5 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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