Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm24888-201ENSMUST00000104387 130 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm27804-201ENSMUST00000185135 119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Tsr1Q5SWD9 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Tsr1Q5SWD9 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Tsr1Q5SWD9 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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