Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d1Q5SSN7 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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