Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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