Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Irf5P56477 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Irf5P56477 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Irf5P56477 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Irf5P56477 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Irf5P56477 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Irf5P56477 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Irf5P56477 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Irf5P56477 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Irf5P56477 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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