Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm14401-201ENSMUST00000108968 247 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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