Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RxraP28700 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RxraP28700 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RxraP28700 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms