Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr1444-201ENSMUST00000059675 1129 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
Spta1P08032 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Spta1P08032 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms