Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms