Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Clip3B9EHT4 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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