Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm1330-202ENSMUST00000109942 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Grik3B1AS29 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.3 ms