Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC116950.1-201ENSMUST00000226322 3250 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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