Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Mir1946a-201ENSMUST00000158360 134 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Rabgef1Q9JM13 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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