Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Ccdc47Q9D024 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms