Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rprd1bQ9CSU0 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rprd1bQ9CSU0 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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