Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Actn1Q7TPR4 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Olfr1079-203ENSMUST00000216480 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Actn1Q7TPR4 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms