Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Ntrk3-201ENSMUST00000039431 19703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm14295-202ENSMUST00000132883 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
NipblQ6KCD5 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
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