Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Usp48Q3V0C5 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Usp48Q3V0C5 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms