Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm28047Q3US59 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms