Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Tmem253Q3UNB8 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tmem253Q3UNB8 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms