Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Shroom4Q1W617 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms