Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Rpl28P41105 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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